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综合所得的个人所得税的计算方式是这样的：首先扣除收入额减费用，标准是每月五千一年六万，除此之外还要减去各项专项扣除等，这一步计算出应纳税所得额；其次，应纳税所得额计算应纳税额要采用超额累进的方式去计算；最后，按照个人所得税法所附的表格，根据不同的收入水平，采用对应的税率去计算即可得到需要缴纳的税额。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》第三条 个人所得税的税率：（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
1、点击【常用业务】中的【综合所得年度汇算】。
2、点击【使用已申报数据填写】并点击【开始申报】。
3、下一步，点击【我已阅读并知晓】。
4、之后，点击【下一步】。
5、这个页面我们可以看到我们的【应纳税所得额】点击【下一步】。
6、我们即可看到【税款计算】计算方式为【应退税额=已缴税额+减免税额-应纳税额】左下角可以看到我们详细的【应退税额】随后，我们点击【提交申报】。
7、这里可以看到【您可申请的退税金额】并点击【申请退税】。
8、我们点击【添加银行卡信息】。
9、输入【银行卡号】【开户银行所在省份】【所属银行】【银行预留手机号码】等点击【下一步】
10、回到上一页点击【确定】及完成所有流程，此版本为ios端超过6W总收入的操作方式。
国家税务总局规定，居民个人取得工资、薪金所得、劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得等综合所得且符合下列情形之一的纳税人，在取得所得的次年3月1日至6月30日内填报《个人所得税年度自行纳税申报表》及其他相关资料，办理汇算清缴或者随汇算清缴一并办理纳税申报。
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