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动物近亲繁殖会产生很多不良后果，无论是人工饲养的猪羊鸡狗等家畜，还是狮虎豹等野生动物，近亲繁殖产生的后代都往往体弱多病，存活机会较少。由于许多遗传基因只有在它们并存于双亲的基因中时才显现出其消极的一面，而双亲的亲缘关系越近，它们的基因特性雷同的机会就越大。
猫近亲繁殖问题主要有以下三点：
1、从医学的角度出发，猫咪近亲繁殖是不能起到改良猫种的作用，但能保持和发扬该猫咪血系的优点和缺点。即近亲繁殖可能将繁殖系统里面猫父母的优点或缺点得到进一步的传承和发扬，让优点扩大，但同时缺点也有可能被扩大。而且遗传的这个缺点在这个猫品种血系的存在是永久性的。
2、近亲繁殖的优缺点不是平均分配在每一只后代猫咪上。当一个繁育学家明确了近亲繁殖的特点，知道近亲繁殖的影响之后，便可以利用近亲繁殖。繁育学家在某些时间、某些情况条件下作近亲繁殖，以此来繁育猫咪。
3、但除存在特殊的原因以外，在猫咪的繁殖问题上，人们应该遵循三代以内禁止近亲繁殖的规定，尽量不要给猫咪选择近亲繁殖的方式。
近亲繁殖效应原意是指血缘相近的种属结合生育后代，导致出现退化或畸变的现象。近亲繁殖指亲缘关系近的家畜个体间交配繁殖。近亲（或称亲缘关系）是指三代或三代以内有共同的祖先。如果他们之间通婚，称为近亲婚配。近亲婚配的夫妇有可能从他们共同祖先那里获得同一基因，并将之传递给子女。如果这一基因按常染色体隐性遗传方式，其子女就可能因为是突变纯合子而发病。因此，近亲婚配增加了某些常染色体隐性遗传疾病的发生风险。而在近亲结婚时，夫妇两人携带相同的隐性致病基因的可能性很大，容易在子代相遇，而使后代遗传病的发病率升高。因此，根据我国目前的人口形势和医疗水平，为了尽量减少近亲结婚造成的遗传缺陷，规定直系血亲和三代以内的旁系血亲禁止结婚。
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