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小孩的脑炎，大部分是由感染因素引起的。当孩子的抵抗力下降的时候，为病原体侵袭，比如病毒、细菌、真菌、支原体、衣原体等感染。感染严重的时候，如果没有得到及时有效的处理，可以经血行透过血脑屏障进入颅内，引起脑膜脑炎。
还有部分小儿脑炎属于免疫性的脑炎，比如自身免疫功能紊乱的情况下，容易出现。还有部分孩子脑炎是由颅脑外伤后引起继发感染，导致脑炎。还有少部分小儿脑炎是感染之外的，比如中毒等。
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