对于脊柱结核的确诊，可以从病史以及症状表现、影像学检查和抽血，或者局部病变组织穿刺、病理组织活检等方法进行综合判断。
脊柱结核往往具有一些原发病病史，比如肺结核，多是由于肺结核或者身体其他部位的结核感染到脊柱而引起的脊柱结核。另外，若出现结核，可能会出现脊柱部位的疼痛、活动功能受限，可能会伴有消瘦、盗汗等结核的症状，抽血检查可能会出现抗结核抗体阳性。
另外，对于脊柱结核，通过CT、核磁共振等可以看到结核的影像学表现。如果还是不能确诊，可以穿刺取标本进行病理组织活检，以明确诊断。
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