便秘严重的患者首先应该进行器质性疾病和功能性疾病的鉴别。
一般检查包括粪便镜检和隐血试验，属于常规检查。如果考虑有肠道炎症，肿瘤或其他系统疾病，需要化验血红蛋白，血糖，甲状腺功能，血钙等。明确肠道是否有器质性疾病，可以进行结肠镜检查或X线钡剂灌肠。特殊检查包括胃肠传输试验，肛门直肠测压，排粪造影，气囊逼出试验，24小时结肠压力监测，会阴神经潜伏期或肌电图检查。有明显焦虑抑郁的患者应该进行心理卫生的问卷调查。
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